graphAqua

Notre mission : démocratiser l’accès aux outils scientifiques numériques

graphAqua est une initiative dédiée à la création, la mise à disposition et la diffusion d’outils numériques gratuits à destination des chercheurs, ingénieurs R&D, doctorants et techniciens impliqués dans des disciplines comme la biologie marine, l’aquaculture, l’écologie expérimentale ou encore la recherche environnementale. Notre objectif est de proposer des solutions open source simples, efficaces et rigoureuses, permettant d’améliorer la fiabilité des protocoles expérimentaux, la qualité des données scientifiques et la reproductibilité des analyses.

Chaque outil proposé par graphAqua est pensé pour répondre à des problématiques concrètes rencontrées sur le terrain ou en laboratoire, que ce soit lors de la conception d’un protocole, de la gestion de lots biologiques ou de l’analyse statistique d’échantillons. Notre philosophie repose sur l’ouverture des connaissances et le partage de ressources scientifiques.

Présentation de nos outils numériques

SAMSEL – Sample Allocation and Selection Tool

SAMSEL est un logiciel conçu pour répartir automatiquement une population d’individus expérimentaux en plusieurs groupes homogènes, selon un ou plusieurs critères quantitatifs (masse, longueur, indice biologique, taux métabolique, etc.). Cette répartition permet d’obtenir des groupes comparables d’un point de vue statistique en éliminant les valeurs extrêmes et en assurant une distribution équilibrée.

Ce type de traitement est indispensable pour tout chercheur souhaitant minimiser les biais lors de la constitution de groupes expérimentaux, notamment dans les essais de type test/témoin, ou lors de l’étude de facteurs environnementaux comme la température, le pH ou la salinité.

Exemple d’application : dans une étude sur les impacts de l’acidification des océans sur la croissance d’Magallana gigas (huître creuse), un lot initial de 150 individus peut être réparti en 4 groupes de 30 individus. SAMSEL permet d’effectuer cette répartition de manière reproductible, transparente et automatisée, garantissant une représentativité optimale des échantillons.

Le logiciel SAMSEL est disponible en version web accessible en ligne depuis cette plateforme, ainsi qu’en version bureau Python open source, hébergée sur GitHub. Il sera prochainement enrichi de fonctionnalités avancées : multi-critères de tri, ajustement des seuils de filtrage, export de protocoles de sélection.